Als ältester, am 11. 6. 1791 geborener, Sohn des k.k. Lotto - Direktions - Sekretärs Josef Partsch und der Katharina Partsch, geb. Martini, erhielt Paul Partsch eine gediegene Ausbildung und studierte, der Familientradition folgend, zunächst Rechtswissenschaften an der Wiener Universität. Im Stift Göttweig bildete er sich anschließend auf Wunsch seines Vormundes Ignaz von Krehs in Rechtspflege und Landwirtschaft praktisch aus. Hier kam er mit den Erdwissenschaften in Kontakt.
Wieder in Wien machte Partsch über den damaligen Kustos am Mineralien - Cabinet, Rochus Schüch, die Bekanntschaft des Direktors Carl von Schreibers. In der Folge beschäftigt er sich sehr intensiv mit der geologischen und mineralogischen Erforschung Niederösterreichs, unterstützt von den Niederösterreichischen Ständen.
Von 1816 bis 1824 ist Partsch Volontär am k.k Naturalien-Cabinet, ab 1824 Aufseher und später Kustos (ab 1835). Zuletzt war er Vorstand des k.k. Mineralogischen Hof-Cabinets. Er stirbt am 3. 10. 1856 in Wien.